主条目：叙利亚内战
2011年1月下旬开始，叙利亚爆发了大规模的反政府示威，巴沙尔及其政府正面临着执政危机。2011年1月31日，《华尔街日报》采访了总统巴沙尔·阿萨德，他表示现在是时候开始改革了；对于发生在突尼斯，埃及和也门等国的运动的看法时，他说中东已经到了一个新时代，阿拉伯统治者需要做更多改变以适应民众不断崛起的经济需要和政治诉求。[13][14]
巴沙尔曾表态叙利亚不会受到埃及示威运动的影响。[15]阿萨德的顾问夏班指责逊尼派教士们煽动了逊尼派民众的叛乱。[16]
2012年3月15日，聯合國秘書長潘基文在敘利亞衝突爆發一周年之際再次發出呼吁，要求敘利亞各派結束一切暴力行為，通過和平手段解決危機。潘基文在3月15日發表的一份書面聲明中指出，一年前的今天，敘利亞民眾走上大馬士革街頭，他們呼吁權利和自由的和平示威運動，在幾天內得到了來自其他城市民眾的響應。然而，敘利亞當局卻對此予以鎮壓，加上不明武裝分子多次策動襲擊，導致遠遠超過8000人死亡，包括大量平民與一部分士兵。[17]
2014年6月3日，敘利亞舉行自阿萨德家族1970年上台以來首次舉行的差額總統選舉，結果，巴沙尔·阿塞德以88.7%當選，成功連任。
6月4日，叙利亚人民议会议长拉哈姆宣布，现任总统巴沙尔·阿萨德在3日举行的总统选举中胜出，成功连任。[18]《紐約時報》認爲，這場選舉「不過是阿薩德進行自我炫耀的一場把戲」，該投票缺乏公正性。[19]
另外，敘利亞反對派還針對這次投票上傳了一段影片，在影片的末尾，一名男子把垃圾丟進了一個外觀與投票箱相似的垃圾箱裏。[20]
2017年4月6日，美國總統川普晚間下令駐地中海美國海軍，向敘利亞政府軍霍姆斯空軍基地，發射五十九枚「戰斧」巡弋飛彈，制裁總統阿萨德。政府軍四日疑似使用沙林毒氣，攻擊該國西北部由反抗軍佔領的伊德利卜省汗舍孔鎮，造成包括兒童在內上百人傷亡的慘劇。美國國防部官員6日深夜強調，此次軍事行動是一次性，美國無意加深涉入敘利亞內戰。2017年9月，联合国战争罪调查员正式指控叙利亚政府对汗谢洪的沙林袭击事件中，造成83人死亡，近300人受伤。国际调查委员也记录了2013年3月至2017年3月期间在叙利亚发生的25起化学袭击事件，其中20起是由政府军实施的，主要是针对平民。[21]
2019年11月，阿薩德在鲁普雷訪問中再度指控美國“資助恐怖份子”打擊敘利亞政府與其盟友。[22]
快速垮台
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主条目：2024年敘利亞反對派攻勢和阿塞德政權垮台
2024年11月下旬起，反抗军在该国西北部开始发动攻势，快速接连拿下阿勒颇、哈马、霍姆斯等重镇，加上南部东南部的反对派武装逐渐包围首都。2024年12月，反抗軍攻佔敘利亞首都大馬士革，敘利亞總統家属据称已离开叙利亚，巴沙尔本人下落不明。[23]路透社後來報道，敘利亞總統巴沙爾從首都大馬士革乘坐飛機，往海岸地區自己的根據地時，飛機在地圖失蹤。報道引述敘利亞消息人士指，如果巴沙爾在機上且萬一失事，很可能已經喪生。[24]
後來俄羅斯宣布，巴沙爾及其親人已經飛抵莫斯科，並且獲得庇護，[25]並且阿萨德也不再是敘利亞總統。[26]數日後一份聲明中，他否認逃亡而是跟隨俄軍行動，不過此前似乎轉移了相當的資產[27]。
被新政府通缉
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2024年12月，叙利亚新领导人阿布·穆罕默德·朱拉尼领导的临时政府悬赏1000万美元通缉前总统巴沙尔·阿萨德，声称其“必须为叙利亚人民的贫困、饥饿和社会动荡负责。”[28]2025年1月下旬，俄罗斯官方代表团对叙利亚进行首次正式访问，叙利亚新政府在会谈期间要求莫斯科“意识到过去的错误”，并要求引渡前总统阿萨德。[29]